נופר צהוב הוא קרוב משפחתה של נימפאה. ישנם קווי דמיון רבים בין הצמחים הללו. רוב עליו של נופר צהוב צפים על פני המים. אם כי, חלק קטן מעליו מצוי בגוף המים באופן תמידי. צורת העלים הצפים היא עגלגלה. בראש העלה קיים מפרץ החותך את צורת העלה, דבר המעניק לעלה צורת לב. גודלו של העלה הוא גדול - קוטרו כ-30 ס"מ. צבעו של העלה הוא ירוק. שמו, "נופר צהוב", ניתן לו משום צבע פרחו. צבע הפרח הוא צהוב. גודלו קטן יחסית (כ-5 ס"מ בלבד). פריחתו מתרחשת בחודשי הקיץ.

נופר צהוב מצוי במקורות מים מתוקים בלבד. לרוב יהיו אלו מקורות מים עומדים או בעלי זרימה איטית. צורת מחייתו של צמח נופר צהוב מאלצת אותו להימצא במקומות רדודים. לרוב יהיו אלו מקומות בעמקים של 40-90 ס"מ בלבד.

שורשיו של נופר צהוב הם ארוכים. אורך שורשיו של פריט בוגר מגיעים לעיתים לפי 3 מאורך הצמח. שורשים ארוכים הללו מאפשרים לנופר להיאחז בקרקע בצורה הדוקה ולשאוב ממנה חומרים מזינים רבים המצויים בעומקה.

נופר צהוב הוא צמח אגרסיבי המתחרה על מקום מחייתו. עליו הצפים על פני המים מכסים שטחים נכבדים בקרבת הצמח. הוא מונע מאור לחדור מבעד לפני המים. בכך הוא מקטין את מגוון הצמחים בסביבתו המתחרים עמו על בית הגידול.

בעבר היה נופר צהוב נפוץ בכל חלקי הארץ שאינם מדבריים, לרבות אזור מישור החוף ועמק החולה. כיום, תפוצתו מוגבלת יותר. למעוניינים לראותו בכל זאת, נמליץ על אזור עמק החולה (עין תאו).